梁德生教授:三代测序新生儿基因筛查,助力“筛诊治”全面升级
值此第四个国际新生儿疾病筛查日之际,第四届全国新生儿基因筛查大会正在上海召开。今日,中南大学医学遗传学研究中心的梁德生教授在会中分享了三代CAH新生儿一线基因筛查多中心研究项目阶段性成果,初步证实三代CAH作为高通量的一线新生儿基因筛查方法的技术可行性,并介绍了在当前“诊治提速”需求背景下,聚焦核心病种,应用三代测序新筛解决方案实现“筛诊一体”的一线新生儿筛查新策略。
第四届全国新生儿基因筛查大会
精彩内容速递
先天性肾上腺增生症(CAH)作为一种严重多发、可筛可治的出生缺陷重点病种,目前已被纳入大部分地区的新生儿筛查范围,而传统CAH筛查及诊断方法存在一定局限性。21-羟化酶缺乏症(21-OHD)是CAH中最常见的类型,占比90-95%,17α-OHP升高是21-羟化酶缺乏症(21-OHD)的特异性诊断指标,有较高的假阴性率、假阳性率及较低的阳性预测值,导致大量初筛阳性新生儿家长不必要的担忧和来回奔波就医。基因检测是CAH诊断金标准,但编码21-羟化酶的CYP21A2基因上游存在一个高度同源的假基因CYP21A1P,在减数分裂的过程中两者容易发生重排而常形成复杂的基因型。传统CAH检测常采用MLPA+Sanger测序组合方式,由于假基因干扰、缺失与重复可能同时存在、引物区域脱扣等原因,该方法组合在CAH检测上仍然存在假阴、假阳等问题,且两种方法组合操作繁琐且价格昂贵,难以适用于一线筛查。
梁德生教授:
01
三代测序实现全面、精准、一步到位的CAH基因检测
中南大学医学遗传学研究中心与贝瑞基因(000710)联合开发的三代测序全面检测CAH的方法(CACAH),利用三代测序长读长、能精准确定缺失、重复融合基因的断裂区间、覆盖全面、检测精准、不依赖家系验证直接区分两个或两个以上位点突变的顺反式关系等优势,可实现CAH的精准诊断。不仅对性早熟、骨龄提前、疑似PCOS、不孕不育等人群的鉴别诊断极具临床应用价值,还在新生儿筛查阶段便可实现CAH的精准基因检测,有效降低患儿确诊时间和就诊成本,利于早期干预治疗,减少家长不必要的奔波和担忧,同时也能发现远期发病的NCCAH患者,避免因漏检而导致终生发育成长被影响。
02
三代测序有望成为高通量的一线新生儿基因筛查方法
三代测序CAH检测方法已发表诸多研究成果并得到专家共识肯定,其中,首个三代CAH新生儿一线基因筛查多中心研究项目也取得阶段性进展。该研究采用三代测序方法,首次在万例级新生儿队列中精准绘制了CAH的缺失、重复、SNVs/InDels等全方位基因变异图谱,明确了致病变异携带率和NCCAH发病率等基线数据,初步证实了三代CAH作为高通量的一线新生儿基因筛查方法的技术可行性:5-7个工作日就可以获得准确结果,基本实现基因组层面的筛诊一体,且具有高通量、检测结果精准、成本可控、流程便捷等优势,有助于形成中国CAH筛查、诊断和精准治疗的临床规范和指南。
03
三代测序新生儿基因筛查解决方案,助力新生儿“筛诊治”全程提速
在当前政策引领下,新筛能力提升的重点为:聚焦核心病种,为新生儿“筛诊治”全程提速。
三代测序新生儿基因筛查解决方案,以严重高发且因筛查手段存在局限性而预防不佳的CAH为核心,在基因筛查疾病列表中同时加入G6PD、非综合征性耳聋、PKU等,不仅满足国家卫健委《出生缺陷防控能力提升计划(2023-2027年)》针对遗传代谢疾病“2周内诊断、2周内干预”的要求,还可以大大降低检测成本,具有更高的卫生经济学价值。将“诊断级技术”的三代测序用于一线基因筛查,具有革命性意义,将开启新生儿基因筛查“全面、精准、普惠”新时代。
贝瑞基因将基于第三代高通量测序技术平台,推出更加精准、全面、高效、普惠、可实现“筛诊一体”的新生儿筛查产品,可进行包括上述4种疾病在内的高发、可筛可治、愈后良好、治疗费用可控的单基因病筛查,有效降低患儿确诊时间和就诊成本,助力新生儿疾病的早筛查、早诊断、早干预、早治疗,守护新生健康。
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